ISSN 2149-2263 | E-ISSN 2149-2271 Home      
 
Volume : 21 Issue : 3
Current Issue Archive Popular Article Ahead of Print

   
Quick Search





 
The Anatolian Journal of Cardiology Association between non-coding polymorphisms of HOPX gene and syncope in hypertrophic cardiomyopathy [Anatol J Cardiol]
Anatol J Cardiol. 2014; 14(7): 617-624 | DOI: 10.5152/akd.2014.4972  

Association between non-coding polymorphisms of HOPX gene and syncope in hypertrophic cardiomyopathy

Çağrı Güleç1, Neslihan Abacı1, Fatih Bayrak2, Evrim Kömürcü Bayrak1, Gökhan Kahveci3, Celal Güven4, Nihan Erginel Ünaltuna1
1Department of Genetics Institute for Experimental Medicine (DETAE), İstanbul University; İstanbul-Turkey
2Department of Cardiology, Faculty of Medicine, Acıbadem University; İstanbul-Turkey
3Clinic of Cardiology, Koşuyolu Kartal Heart Training and Research Hospital; İstanbul-Turkey
4Department of Biophysics, Faculty of Medicine, Adıyaman University; Adıyaman-Turkey

Objective: Homeodomain Only Protein X (HOPX) is an unusual homeodomain protein which regulates Serum Response Factor (SRF) dependent gene expression. Due to the regulatory role of HOPX on SRF activity and the regulatory role of SRF on cardiac hypertrophy, we aimed to investigate the relationship between HOPX gene variations and hypertrophic cardiomyopathy (HCM). Methods: In this study, designed as a case-control study, we analyzed coding and flanking non-coding regions of the HOPX gene through 67 patients with HCM and 31 healty subjects. Certain regions of the gene were investigated by Single Stranded Conformation Polymorphism (SSCP) and Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP). Statistical analyses of genotypes and their relationship with clinical parameters were performed by chi-square, Kruskal-Wallis and the Fisher’s exact test. Results: In 5’ Untranslated Region (UTR) and intronic region of the HOPX gene, we found a C>T substitution and an 8-bp insertion/deletion (In/Del) polymorphism, respectively. These two polymorphisms seemed to constitute an haplotype. While the frequency of homozygous genotypes of In/Del and C/T polymorphisms were found significantly lower in the patients with syncope (p=0.014 and p=0.017, respectively), frequency of their heterozygous genotypes were found significantly higher in the patients with syncope (p=0.048 and p=0.030, respectively). Conclusion: Though there was not found any mutation in coding sequence of HOPX gene, two non-coding polymorphisms were found related to syncope in HCM patients. While homozygous status of these polymorphisms was found to be protective against the syncope, their heterozygous status seemed to be a risk factor for syncope in HCM patients. Our results suggest that HOPX may contribute to pathogenesis or manifestation of HCM as a modifier gene.

Keywords: HOPX, hypertrophic cardiomyopathy, syncope, modifier gene, polymorphism


HOPX geni kodlamayan polimorfizmleri ile hipertrofik kardiyomiyopatideki senkop arasındaki ilişki

Çağrı Güleç1, Neslihan Abacı1, Fatih Bayrak2, Evrim Kömürcü Bayrak1, Gökhan Kahveci3, Celal Güven4, Nihan Erginel Ünaltuna1
1Department of Genetics Institute for Experimental Medicine (DETAE), İstanbul University; İstanbul-Turkey
2Department of Cardiology, Faculty of Medicine, Acıbadem University; İstanbul-Turkey
3Clinic of Cardiology, Koşuyolu Kartal Heart Training and Research Hospital; İstanbul-Turkey
4Department of Biophysics, Faculty of Medicine, Adıyaman University; Adıyaman-Turkey

Amaç: HOPX (Homeodomain Only Protein X), SRF’ye (Serum response factor) bağlı gen anlatımını düzenleyen bir homeodomain proteindir. HOPX’in SRF aktivitesi üzerindeki düzenleyici rolü ve SRF’nin de kardiyak hipertrofideki düzenleyici rolü nedeniyle, HOPX gen varyasyonlarının hipertrofik kardiyomiyopati (HKM) arasındaki ilişkiyi incelemeyi amaçladık. Yöntemler: Vaka-kontrol çalışması niteliğindeki çalışmada, HKM tanılı 67 hastada ve 31 sağlıklı kontrolde, komşuluğundaki kodlamayan bölgelerle birlikte HOPX geninin kodlayan bölgelerini analiz ettik. Genin belirli bölgeleri SSCP (Single Stranded Conformation Polymorphism) ve RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) yöntemleri ile incelendi. Genotipler ve genotiplerin klinik parametrelerle ilişkileri ki-kare, Kruskal-Wallis ve Fisher’s testi ile incelendi. Bulgular: HOPX geninin 5’UTR (Untranslated Region) ve intronik bölgesinde bir C>T dönüşümü ve 8 bazlık insersiyon/delesyon (In/Del) polimorfizmi tespit edildi. HOPX geninin kodlayan bir ekzonunun komşuluğunda yer alan bu polimorfizmlerin bir haplotip oluşturduğu görüldü. In/Del ve C/T polimorfizmlerinin homozigot genotiplerinin sıklığı, senkoplu hastalarda anlamlı düzeyde (sırasıyla p=0,014 ve p=0,017) düşük bulunurken, heterozigot genotiplerinin sıklığı anlamlı düzeyde (sırasıyla p=0,048 ve p=0,030) yüksek bulunmuştur. Sonuç: HOPX geninin kodlayan dizisinde herhangi bir mutasyon bulunmamasına rağmen, bu genin kodlamayan bölgesindeki iki polimorfizmin HKM hastalarındaki senkop ile ilişkili olduğu görüldü. Bu polimorfizmlerin, HKM hastaları için homozigot durumda senkopa karşı koruyucu rol oynarken, heterozigot durumda senkop için bir risk faktörü oluşturduğu görülmüştür. Sonuçlarımız HOPX geninin HKM patogenezinde veya klinik seyrinde modifiye edici bir gen olarak rol oynayabileceğini düşündürmektedir.

Anahtar Kelimeler: HOPX, hipertrofik kardiyomiyopati, senkop, modifiye edici gen, polimorfizm


Çağrı Güleç, Neslihan Abacı, Fatih Bayrak, Evrim Kömürcü Bayrak, Gökhan Kahveci, Celal Güven, Nihan Erginel Ünaltuna. Association between non-coding polymorphisms of HOPX gene and syncope in hypertrophic cardiomyopathy. Anatol J Cardiol. 2014; 14(7): 617-624


TOOLS
Full Text PDF
Print
Download citation
RIS
EndNote
BibTex
Medlars
Procite
Reference Manager
Share with email
Share


Similar articles
PubMed
Google Scholar




 
 
KARE Publishing | Copyright © 2018 Turkish Society of Cardiology